Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FSCN1Q16658 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FSCN1Q16658 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms