Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LY6EQ16553 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms