Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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