Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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