Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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