Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNB1Q14721 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms