Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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