Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HNF4GQ14541 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms