Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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FAM53BQ14153 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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FAM53BQ14153 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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FAM53BQ14153 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FAM53BQ14153 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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