Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKG1Q13976 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms