Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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