Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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