Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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