Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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