Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP3B2Q13367 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms