Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX10Q13206 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX10Q13206 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms