Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms