Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms