Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms