Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLFN5Q08AF3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN5Q08AF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms