Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms