Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA3Q08378 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA3Q08378 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms