Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDR1Q08345 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms