Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms