Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCN1BQ07699 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms