Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms