Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms