Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms