Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP7AQ04656 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms