Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BDH1Q02338 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms