Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms