Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNA1DQ01668 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms