Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLTCQ00610 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms