Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMF1P82094 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMF1P82094 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMF1P82094 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMF1P82094 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms