Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms