Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTG1P63261 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms