Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARF3P61204 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARF3P61204 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARF3P61204 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARF3P61204 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARF3P61204 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARF3P61204 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms