Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms