Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUMO3P55854 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms