Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms