Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERFP50548 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERFP50548 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERFP50548 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERFP50548 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms