Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms