Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms