Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POU3F4P49335 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms