Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AFMP43652 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AFMP43652 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AFMP43652 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AFMP43652 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms