Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETFBP38117 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETFBP38117 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETFBP38117 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETFBP38117 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFBP38117 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFBP38117 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFBP38117 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETFBP38117 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms