Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTN2P35609 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTN2P35609 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms