Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC1P33527 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms