Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDAP32320 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDAP32320 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDAP32320 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDAP32320 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDAP32320 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms