Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCKARP32238 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCKARP32238 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms